Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms