Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms