Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LIN37Q96GY3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LIN37Q96GY3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms