Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MALSU1Q96EH3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MALSU1Q96EH3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms