Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG2BQ96BY7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms