Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX21Q969T3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX21Q969T3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms