Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED12Q93074 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED12Q93074 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms