Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms