Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms