Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPDL3BQ92485 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms