Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCTD13Q8WZ19 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCTD13Q8WZ19 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms