Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSH3Q8TE77 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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