Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDND2Q8NHS1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDND2Q8NHS1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDND2Q8NHS1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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