Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMIEQ8NEW7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMIEQ8NEW7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TMIEQ8NEW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIEQ8NEW7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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