Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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