Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC24Q8N4L8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC24Q8N4L8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.4 ms