Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms