Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms