Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms