Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR88Q6ZMY6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms