Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms