Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RTL6Q6ICC9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RTL6Q6ICC9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RTL6Q6ICC9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RTL6Q6ICC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL6Q6ICC9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RTL6Q6ICC9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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