Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL3Q6DD88 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms