Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF8Q5VWM4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms