Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms