Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms