Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms