Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2SQ16763 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms