Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2B3Q16720 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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