Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIF1AQ16665 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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