Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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