Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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