Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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LAMA4Q16363 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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LAMA4Q16363 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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LAMA4Q16363 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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LAMA4Q16363 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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