Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK3Q16288 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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