Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNGA3Q16281 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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