Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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SNCBQ16143 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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SNCBQ16143 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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