Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms