Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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