Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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