Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCOA1Q15788 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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