Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms