Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms