Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
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PTPRKQ15262 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
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PTPRKQ15262 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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PTPRKQ15262 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRKQ15262 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
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