Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPAQ15257 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms