Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NECTIN1Q15223 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NECTIN1Q15223 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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NECTIN1Q15223 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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NECTIN1Q15223 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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