Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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