Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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