Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms