Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms