Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms